叶面肥可能与农药发生化学或物理反应，影响农药的有效性或造成药害。 若药液有不良表现，则不适宜混合使用。混合后即使药液物理性状良好，也要先进行小范围的试验，看是否容易出现肥害药害，再大面积使用。

一般是用足量的水先配好一种单剂的药液，再用这种药液稀释另一种单剂；而不能先混合两种单剂，再用水稀释，以免发生不良反应，造成有效成分的破坏和物理性状的恶化。叶面肥混用时，叶面肥与农药混合的顺序通常为：叶面肥、可湿性粉剂、悬浮剂、水剂、乳油依次加入，每加入一种即充分搅拌混匀，再加入下一种。

碱性农药不能与铵态氮肥和过磷酸钙等化肥混用否则会使氨挥发损失，降低肥效；含砷的农药不能与钾盐、钠盐类化肥混用，否则会产生可溶性砷而发生药害。